Cerita ini bermula dari penemuan yang tak biasa akan seorang bayi ajaib dan diakhiri dengan terbakarnya sebuah buku. Bayi yang dikatakan merupakan seorang wali karena dilahirkan dari dalam perut seekor ular. Bayi yang diramalkan akan mengubah jalannya sejarah manusia. Dan begitulah aku (Komandante) mendapatkan sebuah buku misterius yang harus aku musnahkan ketika telah selesai membacanya. Buku yang menuntunku pada serangkaian peristiwa gelap yang mewarnai perkembangan sejarah sebuah bangsa. Sebuah buku yang konon ditulis langsung oleh Nur Wali atau Sang Guru Pohon sebagai penanda perjalanan kewaliannya yang hampir memakan seluruh hidupnya. Sebuah buku yang kemudian ditakuti oleh Presiden Notonegoro karena meramalkan kejatuhannya. Dan begitulah aku kemudian menjadi seorang pelarian yang terus hidup dalam bayang-bayang. Seorang pelarian di dalam negeriku sendiri. Hingga pada akhirnya buku itu mengungkapkan sendiri rahasianya melalui sebuah pesan. Pada akhirnya buku itu harus musnah, karena isinya yang mengandung ayat-ayat api pembangkangan. Demikianlah cerita ini dikisahkan, untuk menantang siapa pun yang membacanya untuk berani melakukan perubahan.