Anna, seorang alumni Sekolah Menengah Atas Kesaktian Bangsa, kembali lagi ke sekolahnya yang tercinta untuk mengajar sebagai guru psikiater. Sebagai sekolah yang dinaungi pemerintah secara eksklusif, SMA tersebut sering digunakan sebagai objek percobaan kurikulum atau tata sistem pendidikan terbaru. Alhasil, terciptalah angkatan pertama Prodigious Class yang berisi 30 anak bertalenta khusus, yang dibimbing secara intensif di bawah naungan pemerintah. Kisah ini di ambil dari sudut pandang para anggota Prodigious Class dalam menghadapi tekanan para guru yang berjuang memenuhi tujuan pemerintah dalam memajukan pendidikan bangsa. Namun, disamping kepandaian dan kekuatan luar biasa para anggota Prodigious Class, tersimpan luka batin dalam setiap anggota kelas. Di sinilah Anna akan berpetualang menjelajah dari hati ke hati, perasaan yang tak pernah terungkap dari sebuah Prodigious Class.